ARCHEOMIQUES : Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archéobiologistes

Article publié le 16 juin 2021 | Catégorie(s) : Formations

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod

Organisation : Eva-Maria Geigl

 

Constat de départ 

L’écart méthodologique et conceptuel entre les disciplines de l’archéologie (archéozoologie, paléontologie, [paléo]anthropologie, archéozoologie et archéobotanique) et la génétique est un facteur limitant une collaboration pleine, entière et fructueuse entre ces disciplines et induit des erreurs d’appréciation des résultats et de leurs interprétations. L’objectif de la formation est donc de permettre aux archéologues, archéobiologistes et paléontologues, d’acquérir une vision transversale des points saillants de la paléo/archéo-génomique afin de leur faciliter l’intégration des concepts issus de ces approches qui sont pertinents pour leur propre discipline.

Cette formation s’adresse d’abord aux agents du CNRS, mais aussi des universités, de l’INRAP, des musées et des services d’archéologie ainsi qu’aux acteurs du privé en archéologie.

Enjeux

La formation procurera un enseignement sur les bases de la génétique, les spécificités de la paléo/archéo-génomique, des aspects techniques importants, les bases de la bioinformatique et des méthodes statistiques, ainsi que les contraintes des référentiels utilisés. Les cours aborderont les potentiels et limites des analyses paléogénomiques, les protocoles de prélèvements sur le terrain et de conservation, l’impact de certains traitements ou expositions des os sur la préservation de l’ADN, les difficultés de l’analyse paléogénomique des sédiments, la distinction entre séquences contaminantes et séquences « fossiles » authentiques. La paléoprotéomique sera aussi présentée.

Afin de pouvoir s’adresser à un public large, il est attendu que les participants s’impliqueront dans une préparation active par la lecture préalable d’articles qui seront traités lors de la formation. La formation devrait s’étaler sur deux jours pour pouvoir délivrer un enseignement sur les bases de la génétique, les spécificités de la paléo/archéo-génomique, les aspects techniques importants, les bases de la bioinformatique et des méthodes statistiques, ainsi que les contraintes des référentiels utilisés. Les conférences vont être filmées et mises en ligne.

Objectifs

Action de formation et d’information dans le domaine de la paléo/archéo-génétique-génomique et -protéomique pour les archéologues, paléontologues, paléoanthropologues, archéozoologues et archéobotanistes qui devrait permettre aux agents des différentes communautés des archéosciences:

  • de mieux appréhender ce que la paléo/archéo-génomique apporte et peut encore apporter à l’archéologie et aux archéosciences,
  • de mieux appréhender la façon et les modalités selon lesquelles elle peut enrichir les connaissances dans le domaine des archéosciences mais aussi ce qui limite ces apports,
  • de mieux appréhender en quoi les autres disciplines apportent un cadre d’interprétation indispensables à la paléogénomique.
  • de se faire une idée de l’apport de la paléoprotéomique aux archéosciences

Axes pédagogiques du programme 

Les cours devraient aborder les potentiels et limites des analyses paléo/archéo-génomiques, les protocoles de prélèvements sur le terrain et de conservation, l’impact de certains traitements ou expositions des os sur la préservation de l’ADN, les dangers de l’analyse paléogénomique des sédiments, la distinction entre séquences d’ADN contaminantes et séquences « fossiles » authentiques. Un volet important sera consacré à l’analyse bioinformatique et statistique des séquences d’ADN produites. Par contre, il ne s’agit pas d’une formation dans ces domaines pour les personnes directement impliquées dans les approches archéomiques, mais d’une initiation aux concepts pour les acteurs en archéosciences. La paléoprotéomique sera également traitée lors de ces journées de formation. Finalement, la structuration actuelle de la communauté internationale, les spécificités des différents laboratoires en paléo/archéo-génomique, les contraintes de publications, les aspects éthiques seront présentés.

Inscriptions jusqu’au 4 octobre 2021 ici

Dates : Du lundi 24 janvier 2022 au mercredi 26 janvier 2022

Lieu : Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod

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